В настоящее время БГУ является системообразующим учебным заведением, поскольку готовит кадры для всех органов образования, науки, управления, экономики, здравоохранения, социальной сферы и т. п. Одним из основополагающих принципов БГУ является реализация системы непрерывной подготовки научных и научно-педагогических кадров: от школ, колледжей к университету, аспирантуре, докторантуре.
Университет включает в себя 7 факультетов, 6 институтов, и колледж.
На 72 кафедрах и в 23 научных подразделениях работают более 150 докторов наук и профессоров, около 500 кандидатов наук и доцентов. Среди преподавателей - 2 член-корреспондента государственных академий РАН, РАО, РАМН, а также более 30 академиков и член-корреспондентов общественных академий России.
БГУ располагает самым крупным научным потенциалом в Байкальском регионе. В нем осуществляются практически все виды фундаментальных исследований. На многих кафедрах ведутся прикладные и инновационные исследования. В университете сложились ведущие научные школы мирового уровня в области физики конденсированного состояния, ботаники, орнитологии, истории, монголоведения, социологии, философии, литературы, лингвистики, педагогики.
